TCR基因的結(jié)構(gòu)和重排與Ig基因有許多相似之處。在胚系中，編碼TCR多肽鏈的DNA是由幾個(gè)分隔開(kāi)的DNA片段組成，在胸腺細(xì)胞中重排后，形成編碼一條完整多肽的基因。TCR多肽鏈可變區(qū)基因是由2～4個(gè)基因片段通過(guò)重排連接在一起。V基因片段編碼信號(hào)序列和可變區(qū)氨基端95～100個(gè)氨基酸殘基；J基因片段編碼可變區(qū)羧基端13～23個(gè)氨基酸殘基。TCRβ、δ鏈V區(qū)基因除V、J基因片段外，還有1～2個(gè)D基因片段，編碼V與J之間數(shù)個(gè)氨基酸殘基。TCR不同多肽鏈可變區(qū)基因的重排可有V-J、V-D-J或V-D-D-J等幾種方式。TCR多肽鏈C基因片段通常由3～4個(gè)外顯子所組成，位于J基因片段的下游。與IgC基因片段不同，TCr C基因片段是由數(shù)個(gè)外顯子編碼一個(gè)結(jié)構(gòu)域，如β鏈的連接肽（connecting peptide)是由3個(gè)分隔的外顯子所編碼。
（一)TCRα鏈基因
TCRα鏈基因與TCRβ鏈和Ig基因結(jié)構(gòu)有很大差別。小鼠α鏈V基因約100個(gè)，至少可分為12個(gè)家族。人Vα大約在100個(gè)左右，長(zhǎng)約數(shù)百個(gè)kb。TCRα基因沒(méi)有Dα基因片段。人和小鼠α鏈基因都含有J基因片段（Jα)，小鼠約有60個(gè)，相互間隔至少500bp。VαJα連接具有多樣性。TCRα鏈基因只有1個(gè)Cα基因片段，含有4個(gè)外顯子。在TCRα鏈基因座中有TCRδ鏈基因。TCRα鏈基因重組信號(hào)中長(zhǎng)的間隔序列（23bp)3′端靠近Vα，短的間隔序列（12bp)的5′端靠近Jα，這種重組信號(hào)的排列方式類(lèi)似Ig輕鏈V區(qū)的基因，允許Vα基因直接與Jα基因重排，而不需要VD基因片段。醫(yī)學(xué)全.在線提供
（二)TCRβ鏈基因
小鼠胚系中未重排的β鏈基因結(jié)構(gòu)已經(jīng)搞清，長(zhǎng)約數(shù)百kb。Vβ基因數(shù)目約30個(gè)，大多數(shù)Vβ基因片段位于Cβ1的上游，至少有1個(gè)Vβ（Vβ14)在Cβ2基因3′下游10kb處，與轉(zhuǎn)錄的方向相反。人Vβ基因片段約有100個(gè)。小鼠和人都有2個(gè)Dβ基因片段，12～14bp長(zhǎng)，分別位于Jβ1和Jβ2基因片段組上游約500～600bp處。小鼠和人都有2組（cluster)Jβ基因片段，稱(chēng)為Jβ1和Jβ2，與相應(yīng)的Cβ1和Cβ2基因片段間隔2～3kb。小鼠Jβ1和Jβ2各含7個(gè)Jβ基因片段，其中6個(gè)有功能，Jβ基因片段相互間隔36～421bp。人Jβ1和Jβ2各含7個(gè)有功能的Jβ基因片段。人和鼠TCRβ基因都有2個(gè)基本相同的Cβ基因片段，各含4個(gè)外顯子。Cβ1和Cβ2高度同源，2個(gè)Cβ基因片段的編碼產(chǎn)物中只有4個(gè)氨基酸殘基（小鼠)或5個(gè)氨基酸（人)不同。
TCRα和β鏈V基因編碼區(qū)域包括了相當(dāng)于Ig的CDR1和CDR2，主要是識(shí)別MHC分子和抗原的復(fù)合物。CDR3主要是由于V-D-J或V-D-D-J連接的多樣性（junctional diversity)和廣泛分布的N核苷酸插入（N nucleotide insertion)所造成，其有高度的多樣性，可識(shí)別眾多種類(lèi)的抗原。
圖3-15 小鼠TCR基因的結(jié)構(gòu)
