公開(公告)號(hào)
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CN1539020A
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公開(公告)日
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2004.10.20
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申請(qǐng)(專利)號(hào)
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CN02815270.0
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申請(qǐng)日期
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2002.06.28
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專利名稱
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用于確定作為抗菌藥物的D-Ala-D-Ala連接酶抑制劑的基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)方法
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主分類號(hào)
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C12Q1/37
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分類號(hào)
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C12Q1/37
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分案原申請(qǐng)?zhí)? |
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優(yōu)先權(quán)
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2001.6.28 US 60/301,676
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申請(qǐng)(專利權(quán))人
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醫(yī)賢治療學(xué)公司;普利瓦股份公司
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發(fā)明(設(shè)計(jì))人
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M·A·納維亞;P·J·阿拉;J·P·格利菲斯;J·A·阿里;C·H·法爾曼;S·T·莫;A·S·馬吉;P·R·康納利;E·佩羅拉
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地址
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美國(guó)馬薩諸塞州
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頒證日
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國(guó)際申請(qǐng)
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PCT/US2002/020465 2002.6.28
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進(jìn)入國(guó)家日期
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2004.02.03
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專利代理機(jī)構(gòu)
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中國(guó)國(guó)際貿(mào)易促進(jìn)委員會(huì)專利商標(biāo)事務(wù)所
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代理人
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唐偉杰
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國(guó)省代碼
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美國(guó);US
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主權(quán)項(xiàng)
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評(píng)價(jià)化學(xué)實(shí)體締合下列物質(zhì)的可能性的方法:包含結(jié)合口袋的分子或分子復(fù)合物,所述結(jié)合口袋依據(jù)附圖8由D-Ala-D-Ala連接酶大腸桿菌氨基酸Lys144,Glu180,Lys181,Leu183,Glu187,Asp257和Glu270的結(jié)構(gòu)坐標(biāo)所限定;或所述分子或分子復(fù)合物的同源物,其中所述同源物包含結(jié)合口袋,所述結(jié)合口袋具有與所述氨基酸主鏈原子不超過(guò)10的均方根偏差,所述方法包括下列步驟:采用計(jì)算方法在化學(xué)實(shí)體與結(jié)合口袋之間進(jìn)行擬合操作,其中所述結(jié)合口袋由D-Ala-D-Ala連接酶大腸桿菌氨酸Lys144,Glu180,Lys181,Leu183,Glu187,Asp257和Glu270的結(jié)構(gòu)坐標(biāo)+/-不超過(guò)10的與所述氨基酸主鏈原子的均方根偏差所限定;和分析所述擬合操作的結(jié)果以定量化學(xué)實(shí)體與結(jié)合口袋之間的締合。
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摘要
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本發(fā)明是基于下述發(fā)現(xiàn):一些小分子可結(jié)合D-Ala-D-Ala連接酶的ATP結(jié)合位點(diǎn),甚至在沒有酶底物存在的情況下也是如此,并且可引起類似于在ATP和底物與酶結(jié)合時(shí)所發(fā)生的酶結(jié)構(gòu)的構(gòu)象改變。雖然不希望受敷于理論,但據(jù)信,這樣的構(gòu)象改變是激活或抑制酶所必需的。從該發(fā)現(xiàn)所獲得的信息已使得能夠鑒定酶活性位點(diǎn)中的關(guān)鍵相互作用,以及設(shè)計(jì)和優(yōu)化抑制劑。
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國(guó)際公布
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WO2003/002063 英 2003.1.9
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