三 提取和純化
提取是將經(jīng)過處理或破碎的細胞,置于一定的條件和溶液中,讓被提取的生物大分子充分釋放出來的過程。影響提取的因素主要是被提取物質(zhì)在提取的溶液中溶解度的大小及由固相擴散到液相的難易程度。某一物質(zhì)在溶劑中溶解度大小與該物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)及溶劑理化性質(zhì)有關,一般遵守“相似相溶”的原則。擴散作用對生物大分子的提取有一定的影響。減小溶劑的粘度、攪拌和延長提取時間可提高其擴散速度,增加提取效果,提取的原則是“少量多次”,即對于等量的提取溶液,分多次提取比一次提取效果好得多。
(一)蛋白質(zhì)(包括酶)的提取
大部分蛋白質(zhì)都可溶于水、稀鹽、稀酸或稀堿溶液,少數(shù)與脂類結(jié)合的蛋白質(zhì)則溶于乙醇、丙酮、丁醇等有機溶劑中,因此,可采用不同溶劑提取分離和純化蛋白質(zhì)及酶。
1、水溶液提取法
稀鹽和緩沖系統(tǒng)的水溶液對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性好,溶解度大,是提取蛋白質(zhì)最常用的溶劑,通常用量是原材料體積的1~5倍,提取時需要均勻地攪拌,以利于蛋白質(zhì)的溶解。提取的溫度一般采用低溫(5℃以下)操作。為了避免蛋白質(zhì)提取過程中的降解,可加入蛋白水解酶抑制劑(如二異丙基氟磷酸、碘乙酸等)。
下面著重討論提取液的pH和鹽濃度的選擇:
(1)pH 蛋白質(zhì)和酶是具有等電點的兩性電解質(zhì),提取液的pH應選擇在偏離等電點兩側(cè)的pH范圍內(nèi)。用稀酸或稀堿提取時,應防止過酸或過堿而引起蛋白質(zhì)可解離基團發(fā)生變化,從而導致蛋白質(zhì)構(gòu)象的不可逆變化,一般來說,堿性蛋白質(zhì)用偏酸性的提取液提取,而酸性蛋白質(zhì)用偏堿性的提取液提取。
(2)鹽濃度 稀鹽溶液可促進蛋白質(zhì)的溶解,稱為鹽溶作用醫(yī)學.全在.,線提,供payment-defi.com。同時稀鹽溶液因鹽離子與蛋白質(zhì)部分結(jié)合,具有保護蛋白質(zhì)不易變性的優(yōu)點,因此在提取液中加入少量NaCL等中性鹽,一般以0.15mol/L濃度為宜。緩沖液常采用0.02~0.05mol/L磷酸鹽或碳酸鹽的等滲鹽溶液。
2、有機溶劑提取法
一些和脂質(zhì)結(jié)合比較牢固或分子中非極性側(cè)鏈較多的蛋白質(zhì)和酶,可用乙醇、丙酮或丁醇等有機溶劑提取。它們具有一定的親水性,還有較強的親脂性,是理想的提取脂蛋白的提取液,但必須在低溫下操作。
丁醇提取法對提取一些與脂質(zhì)結(jié)合緊密的蛋白質(zhì)和酶特別優(yōu)越,一是因為丁醇親脂性強,特別是溶解磷脂的能力強;二是丁醇兼具親水性,在溶解度范圍內(nèi)不會引起酶的變性失活。另外,丁醇提取法的pH及溫度選擇范圍較廣,也適用于動植物及微生物材料。
(二)蛋白質(zhì)的分離純化
蛋白質(zhì)的分離純化方法很多,主要有以下幾類。
1、根據(jù)蛋白質(zhì)溶解度不同的分離方法
(1)蛋白質(zhì)的鹽析 中性鹽對蛋白質(zhì)的溶解度有顯著影響,一般在低鹽濃度下隨著鹽濃度升高,蛋白質(zhì)的溶解度增加,稱為鹽溶;當鹽濃度繼續(xù)升高時,蛋白質(zhì)的溶解度不同程度下降并先后析出,這種現(xiàn)象叫鹽析。將大量鹽加到蛋白質(zhì)溶液中,高濃度的鹽離子如硫酸銨有很強的水化作用,可奪取蛋白質(zhì)分子的水化層,使之“失水”,于是蛋白質(zhì)膠粒凝結(jié)并沉淀析出。鹽析時若溶液pH在蛋白質(zhì)等電點則效果更好。由于各種蛋白質(zhì)分子顆粒大小、親水程度不同,故鹽析所需的鹽濃度也不一樣,因此調(diào)節(jié)混合蛋白質(zhì)溶液中的中性鹽濃度可使各種蛋白質(zhì)分段沉淀。
蛋白質(zhì)鹽析常用的中性鹽,主要有硫酸銨、硫酸鎂、硫酸鈉、氯化鈉、磷酸鈉等。其中應用最多的是硫酸銨,它的優(yōu)點是溶解度的溫度系數(shù)小而溶解度大(25℃時飽和溶液為4.1mol/L,即541.2g/L;0℃時溶解度為3.9mol/L(514.8g/L),在這一溶解度范圍內(nèi),許多蛋白質(zhì)和酶都可以鹽析出來;另外硫酸銨分段鹽析效果也比其他鹽好,不易引起蛋白質(zhì)變性。硫酸銨溶液的pH常在4.5~5.5之間,當用其他pH進行鹽析時,需要硫酸或氨水調(diào)節(jié)。
蛋白質(zhì)在用鹽析沉淀分離后,需要將蛋白質(zhì)中的鹽除去,常用的辦法是透析,即把蛋白質(zhì)溶液裝入透析袋內(nèi)(常用的是玻璃紙),用緩沖液進行透析,并不斷地更換緩沖液,因透析所需時間較長,所以最好在低溫中進行。此外也可用葡聚糖凝膠G—25或G-50過柱的辦法除鹽,所用的時間比較短。
(2)等電點沉淀法 蛋白質(zhì)在靜電狀態(tài)時顆粒之間的靜電斥力最小,因而溶解度也最小,各種蛋白質(zhì)的等電點有差別,可利用調(diào)節(jié)溶液的pH達到某一蛋白質(zhì)的等電點使之沉淀,但此法很少單獨使用,可與鹽析法結(jié)合使用。
(3)低溫有機溶劑沉淀法 用與水可混溶的有機溶劑,甲醇,乙醇或丙酮,可使多數(shù)蛋白質(zhì)溶解度降低并析出。此法分離效率比鹽析高,但蛋白質(zhì)較易變性,應在低溫下進行。
2、根據(jù)蛋白質(zhì)分子大小的差別的分離方法
(1)透析與超濾 透析法是利用半透膜將分子大小不同的蛋白質(zhì)分子分開。超濾法是利用高壓力或離心力,強使水和其他小的溶質(zhì)分子通過半透膜,而蛋白質(zhì)留在膜上,可選擇不同孔徑的濾膜截留不同相對分子質(zhì)量的蛋白質(zhì)。
(2)凝膠過濾法 也稱分子排阻層析或分子篩層析,這是根據(jù)分子大小分離蛋白質(zhì)混合物最有效的方法之一。柱中最常用的填充材料是葡聚糖凝膠和瓊脂糖凝膠(詳見層析技術)。
3、根據(jù)蛋白質(zhì)帶電性質(zhì)進行分離
蛋白質(zhì)在不同pH環(huán)境中帶電性質(zhì)和電荷數(shù)量不同,可將其分開。
(1)電泳法 各種蛋白質(zhì)在同一pH條件下,因相對分子質(zhì)量和電荷數(shù)量不同而在電場中的遷移率不同而得以分開(詳見電泳技術)。值得重視的是等電聚焦電泳,這是利用一種兩性電解質(zhì)作為載體,電泳時兩性電解質(zhì)形成一個由正極到負極逐漸增加的pH梯度,當帶一定電荷的蛋白質(zhì)在其中泳動時,到達各自等電點的pH位置就停止,此法可用于分析和制備各種蛋白質(zhì)。
(2)離子交換層析法 離子交換劑有陽離子交換劑(如:羧甲基纖維素)和陰離子交換劑(二乙基氨基乙基纖維素),當被分離的蛋白質(zhì)溶液流經(jīng)離子交換層析柱時,帶有與離子交換劑相反電荷的蛋白質(zhì)被吸附在離子交換劑上,隨后用改變pH或離子強度的辦法將吸附的蛋白質(zhì)洗脫下來(詳見層析技術)。
4、根據(jù)配體特異性的分離方法———親和層析法
親和層析法是分離蛋白質(zhì)的一種極為有效的方法,它通常只需經(jīng)過一步處理即可使某種待提純的蛋白質(zhì)從很復雜的蛋白質(zhì)混合物中分離出來,而且純度很高。這種方法是根據(jù)某些蛋白質(zhì)與另一種稱為配體的分子能特異而非共價地結(jié)合。例如,酶-輔酶,抗原-抗體,激素-受體等。(親和層析的基本原理詳見層析技術)
蛋白質(zhì)在組織或細胞中是以復雜的混合物形式存在,每種類型的細胞都含有上千種不同的蛋白質(zhì),因此蛋白質(zhì)的分離、提純和鑒定是生物化學中的重要部分,至今還沒有一個單獨或一套現(xiàn)成的方法能把任何一種蛋白質(zhì)從復雜的混合蛋白質(zhì)中提取出來,因此往往采取幾種方法聯(lián)合使用。
(三)核酸的提取
核酸都溶于水,而不溶于有機溶劑,利用此性質(zhì)進行提取。在細胞內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合成脫氧核糖核蛋白(DNP),RNA與蛋白質(zhì)結(jié)合成核糖核蛋白(RNP),在不同濃度的鹽溶液中它們的溶解度差別很大,DNP在純水或1 mol/LNaCl溶液中溶解度較大,但在0.14mol/LNaCl溶液中溶解度很低,相反,RNP易溶解。因此,用0.14mol/LNaCl溶液可簡單地初步分開DNP和RNP。
在分離核酸中最困難的是將核酸與緊密結(jié)合的蛋白質(zhì)分開,而且還要避免核酸的降解。常用的解離劑是陰離子去垢劑,如脫氧膽酸鈉,十二烷基硫酸鈉(SDS),4-氨基水楊酸鈉和萘-1,5-二磺酸鈉等,它們具有溶解病毒、細菌的作用,可使核酸從蛋白質(zhì)上游離出來,還具有抑制核糖核酸酶的作用。另外除去核酸中的蛋白質(zhì)的一個有效辦法是用酚-氯仿混合液,它們可使蛋白質(zhì)變性,并對核糖核酸酶有抑制作用,另外氯仿比重大可使有機相和水相完全分開,減少殘留在水相中的酚。在用酚-氯仿抽提核酸提取液時,還須要劇烈振搖,為防止起泡和促使水相與有機相的分離,在酚-氯仿抽提液中再加上一定量的異戊醇。
(四)核酸的純化
核酸的純化最關鍵步驟是去除蛋白質(zhì),通常只要用酚/氯仿、氯仿抽提核酸的水溶液即可。每當需要把DNA克隆操作的某一步所用的酶滅活或去除以便進行下一步時,可進行這種抽提。然而,如果從細胞裂解液等復雜的分子混合物中純化核酸,則要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白質(zhì)后,再用有機溶劑抽提。這些廣譜的蛋白酶包括鏈霉蛋白酶及蛋白酶K等,它們對多數(shù)天然蛋白質(zhì)均有活性。
用酚/氯仿抽提:這兩種有機溶劑合用,比單獨用酚抽提除蛋白效果更佳。繼而用氯仿抽提則可除去核酸制品中的痕量酚。具體步驟如下:
①核酸樣品置有蓋小離心管中,加入等體積的酚/氯仿;②旋渦混勻管內(nèi)容物,使呈乳狀;③12000g室溫離心15s;④水相移入另一離心管,棄去兩相界面和有機相;⑤重復步驟①~④,直至兩相界面上無蛋白質(zhì)為止;⑥加入等體積的氯仿并重復②~④步操作;⑦按下述核酸濃縮法沉淀回收核酸。
(五)核酸的濃縮
應用最廣的核酸濃縮法是乙醇沉淀法。在中等濃度單價陽離子存在下,加入一定量的乙醇后,所形成的核酸沉淀可經(jīng)離心而回收。甚至對低至pg(皮克)量的DNA或RNA,也可定量回收。回收的核酸可按所需濃度,再溶于適當?shù)木彌_液中。具體操作時,可向含樣品的小離心管中加入單價陽離子鹽貯存液。單價陽離子鹽的選擇,主要基于下述考慮:用醋酸銨可減少dNTP的共沉淀,但在以后要作核酸的磷酸化時應避免用醋酸銨,因銨離子是多核苷酸激酶的強烈抑制劑。當用較高濃度的乙醇沉淀RNA時,常用LiCl,因LiCl在乙醇中溶解度很高,不隨核酸共沉淀。含有SDS的核酸樣品,應使用NaCl,這時該去垢劑在70%乙醇中仍保持可溶。
DNA和RNA的沉淀,大多使用醋酸鈉(pH5.2)。