網(wǎng)站首頁
醫(yī)師
藥師
護士
衛(wèi)生資格
高級職稱
住院醫(yī)師
畜牧獸醫(yī)
醫(yī)學考研
醫(yī)學論文
醫(yī)學會議
考試寶典
網(wǎng)校
論壇
招聘
最新更新
網(wǎng)站地圖
中醫(yī)理論中醫(yī)臨床診治中醫(yī)藥術(shù)語標準中國方劑數(shù)據(jù)庫中醫(yī)疾病數(shù)據(jù)庫OCT說明書不良反應中草藥圖譜藥物數(shù)據(jù)藥學下載
您現(xiàn)在的位置: 醫(yī)學全在線 > 中醫(yī)理論 > 中醫(yī)書籍 > 正文:第三節(jié) 真核基因表達調(diào)控
    

生物化學與分子生物學:第三節(jié) 真核基因表達調(diào)控

一、真核基因組的復雜性與原核生物比較,真核生物的基因組更為復雜,可列舉如下。▲真核基因組比原核基因組大得多,大腸桿菌基因組約4×106bp,哺乳類基因組在109bp數(shù)量級,比細菌大千倍;大腸桿菌約有4000個基因,人則約有10萬個基因。▲真核生物主要的遺傳物質(zhì)與組蛋白…

一、真核基因組的復雜性

與原核生物比較,真核生物的基因組更為復雜,可列舉如下。

▲真核基因組比原核基因組大得多,大腸桿菌基因組約4×106bp,哺乳類基因組在109bp數(shù)量級,比細菌大千倍;大腸桿菌約有4000個基因,人則約有10萬個基因。

▲真核生物主要的遺傳物質(zhì)與組蛋白等構(gòu)成染色質(zhì),被包裹在核膜內(nèi),核外還有遺傳成分(如線粒體DNA等),這就增加了基因表達調(diào)控的層次和復雜性。

▲原核生物的基因組基本上是單倍體,而真核基因組是二倍體。

▲如前所述,細菌多數(shù)基因按功能相關(guān)成串排列,組成操縱元的基因表達調(diào)控的單元,共同開啟或關(guān)閉,轉(zhuǎn)錄出多順反子(polycistron)的mRNA;真核生物則是一個結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄生成一條mRNA,即mRNA是單順反子(monocistron),基本上沒有操縱元的結(jié)構(gòu),而真核細胞的許多活性蛋白是由相同和不同的多肽形成的亞基構(gòu)成的,這就涉及到多個基因協(xié)調(diào)表達的問題,真核生物基因協(xié)調(diào)表達要比原核生物復雜得多。

▲原核基因組的大部分序列都為基因編碼,而核酸雜交等實驗表明:哺乳類基因組中僅約10%的序列為蛋白質(zhì)、rRNA、tRNA等編碼,其余約90%的序列功能至今還不清楚。

▲原核生物的基因為蛋白質(zhì)編碼的序列絕大多數(shù)是連續(xù)的,而真核生物為蛋白質(zhì)編碼的基因絕大多數(shù)是不連續(xù)的,即有外顯子(exon)和內(nèi)含子(intron),轉(zhuǎn)錄后需經(jīng)剪接(splicing)去除內(nèi)含子,才能翻譯獲得完整的蛋白質(zhì),這就增加了基因表達調(diào)控的環(huán)節(jié)。

▲原核基因組中除rRNA、tRNA基因有多個拷貝外,重復序列不多。哺乳動物基因組中則存在大量重復序列(repetitive sequences)。用復性動力學等實驗表明有三類重復序列:①高度重復序列(highly repetitive sequences),這類序列一般較短,長10-300bp,在哺乳類基因組中重復106次左右,占基因組DNA序列總量的10-60%,人的基因組中這類序列約占20%,功能還不明了。②中度重復序列(moderatelyrepetitive sequences),這類序列多數(shù)長100-500bp,重復101-105次,占基因組10-40%。例如哺乳類中含量最多的一種稱為Alu的序列,長約300bp,在哺乳類不同種屬間相似,在基因組中重復3-×105次,在人的基因組中約占7%,功能也還不很清楚。在人的基因組中18S/28SrRNA基因重復280次,5SrRNA基因重復2000次,tRNA基因重復1300次,5種組蛋白的基因串連成簇重復30-40次,這些基因都可歸入中度重復序列范圍。③單拷貝序列(single copy sequences)。這類序列基本上不重復,占哺乳類基因組的50-80%,在人基因組中約占65%。絕大多數(shù)真核生物為蛋白質(zhì)編碼的基因在單倍體基因組中都不重復,是單拷貝的基因。

從上述可見真核基因組比原核基因組復雜得多,至今人類對真核基因組的認識還很有限,使現(xiàn)在國際上制訂的人基因組研究計劃(human gene project)完成,繪出人全部基因的染色體定位圖,測出人基因組109bp全部DNA序列后,要搞清楚人全部基因的功能及其相互關(guān)系,特別是要明了基因表達調(diào)控的全部規(guī)律,還需要經(jīng)歷很長期艱巨的研究過程。

二、真核基因表達調(diào)控的特點

盡管我們現(xiàn)在對真核基因表達調(diào)控知道還不多,但與原核生物比較它具有一些明顯的特點。

(一)真核基因表達調(diào)控的環(huán)節(jié)更多

如前所述,基因表達是基因經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯、產(chǎn)生有生物活性的蛋白質(zhì)的整個過程。同原核生物一樣,轉(zhuǎn)錄依然是真核生物基因表達調(diào)控的主要環(huán)節(jié)。但真核基因轉(zhuǎn)錄發(fā)生在細胞核(線粒體基因的轉(zhuǎn)錄在線粒體內(nèi)),翻譯則多在胞漿,兩個過程是分開的,因此其調(diào)控增加了更多的環(huán)節(jié)和復雜性,轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控占有了更多的分量。圖19-13扼要地列出真核基因表達的各個可能的環(huán)節(jié)。

圖19-13 真核生物基因表達調(diào)控的可能環(huán)節(jié)

圖19-13總結(jié)了以前章節(jié)敘述過的基因表達過程,并作了一些新補充。圖中標出了真核細胞在分化過程中會發(fā)生基因重排(gene rearrangement),即胚原性基因組中某些基因會再組合變化形成第二級基因。例如編碼完整抗體蛋白的基因是在淋巴細胞分化發(fā)育過程中,由原來分開的幾百個不同的可變區(qū)基因經(jīng)選擇、組合、變化,與恒定區(qū)基因一起構(gòu)成穩(wěn)定的、為特定的完整抗體蛋白編碼的可表達的基因。這種基因重排使細胞可能利用幾百個抗體基因的片段,組合變化而產(chǎn)生能編碼達108種不同抗體的基因,其中就有復雜的基因表達調(diào)控機理。

此外,真核細胞中還會發(fā)生基因擴增(geneamplification),即基因組中的特定段落在某些情況下會復制產(chǎn)生許多拷貝。最早發(fā)現(xiàn)的是的成熟卵細胞在受精后的發(fā)育過程中其rRNA基因(可稱為rDNA)可擴增2000倍,以后發(fā)現(xiàn)其他動物的卵細胞也有同樣的情況,這很顯然適合了受精后迅速發(fā)育分裂要合成大量蛋白質(zhì),需要有大量核糖體。又如MTX(methotrexate)是葉酸的結(jié)構(gòu)類似物,一些哺乳類細胞會對含有利用葉酸所必需的二氫葉酸還原酶(dihydrofolate reductase, DHFR)基因的DNA區(qū)段擴增40?00倍,使DHFR的表達量顯著增加,從而提高對MTX的抗性;虻臄U增無疑能夠大幅度提高基因表達產(chǎn)物的量,但這種調(diào)控機理至今還不清楚。

(二)真核基因的轉(zhuǎn)錄與染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)變化相關(guān)

真核基因組DNA絕大部分都在細胞核內(nèi)與組蛋白等結(jié)合成染色質(zhì),染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)、染色質(zhì)中NA和組蛋白的結(jié)構(gòu)狀態(tài)都影響轉(zhuǎn)錄,至少有以下現(xiàn)象:

1.染色質(zhì)結(jié)構(gòu)影響基因轉(zhuǎn)錄 細胞分裂時染色體的大部分到間期時松開分散在核內(nèi),稱為常染色質(zhì)(euchromatin),松散的染色質(zhì)中的基因可以轉(zhuǎn)錄。染色體中的某些區(qū)段到分裂期后不像其他部分解旋松開,仍保持緊湊折疊的結(jié)構(gòu),在間期核中可以看到其濃集的斑塊,稱為異染色質(zhì)(heterochromatin),其中從未見有基因轉(zhuǎn)錄表達;原本在常染色質(zhì)中表達的基因如移到異染色質(zhì)內(nèi)也會停止表達;哺乳類雌體細胞2條X染色體,到間期一條變成異染色質(zhì)者,這條X染色體上的基因就全部失活?梢娋o密的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)阻止基因表達。

2.組蛋白的作用 早期體外實驗觀察到組蛋白與DNA結(jié)合阻止DNA上基因的轉(zhuǎn)錄,去除組蛋基因又能夠轉(zhuǎn)錄。組蛋白是堿性蛋白質(zhì),帶正電荷,可與DNA鏈上帶負電荷的磷酸基相結(jié)合,從而遮蔽了DNA分子,妨礙了轉(zhuǎn)錄,可能扮演了非特異性阻遏蛋白的作用;染色質(zhì)中的非組蛋白成分具有組織細胞特異性,可能消除組蛋白的阻遏,起到特異性的去阻遏促轉(zhuǎn)錄作用。

發(fā)現(xiàn)核小體后,進一步觀察核小體結(jié)構(gòu)與基因轉(zhuǎn)錄的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)活躍轉(zhuǎn)錄的染色質(zhì)區(qū)段,有富含賴氨酸的組蛋白(H1組蛋白)水平降低,H2A·H2B組蛋白二聚體不穩(wěn)定性增加、組蛋白乙;(acetylation)和泛素化(ubiquitination),以及H3組蛋白巰基化等現(xiàn)象,這些都是核小體不穩(wěn)定或解體的因素或指征。轉(zhuǎn)錄活躍的區(qū)域也常缺乏核小體的結(jié)構(gòu)。這些都表明核小體結(jié)構(gòu)影響基因轉(zhuǎn)錄。

3.轉(zhuǎn)錄活躍區(qū)域?qū)怂崦缸饔妹舾卸仍黾印∪旧|(zhì)DNA受DNase Ⅰ作用通常會被降解成00、400……payment-defi.com/zhuyuan/bp的片段,反映了完整的核小體規(guī)則的重復結(jié)構(gòu)。但活躍進行轉(zhuǎn)錄的染色質(zhì)區(qū)域受DNase Ⅰ消化常出現(xiàn)100-200bp的DNA片段,且長短不均一,說明其DNA受組蛋白掩蓋的結(jié)構(gòu)有變化,出現(xiàn)了對DNase Ⅰ高敏感點(hypersensitive site)。這種高敏感點常出現(xiàn)在轉(zhuǎn)錄基因的5′側(cè)區(qū)(5′flanking region)、3′末端或在基因上,多在調(diào)控蛋白結(jié)合位點的附近,分析該區(qū)域核小體的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,可能有利于調(diào)控蛋白結(jié)合而促進轉(zhuǎn)錄。

4.DNA拓撲結(jié)構(gòu)變化 天然雙鏈DNA的構(gòu)象大多是負性超螺旋。當基因活躍轉(zhuǎn)錄時,RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄方向前方DNA的構(gòu)象是正性超螺旋,其后面的DNA為負性超螺旋。正性超螺旋會拆散核小體,有利于RNA聚合酶向前移動轉(zhuǎn)錄;而負性超螺旋則有利于核小體的再形成。

5.DNA堿基修飾變化 真核DNA中的胞嘧啶約有5%被甲基化為5甲基胞嘧啶(5methylcytidine,m5C),而活躍轉(zhuǎn)錄的DNA段落中胞嘧啶甲基化程度常較低。這種甲基化最常發(fā)生在某些基因5′側(cè)區(qū)的CpG序列中,實驗表明這段序列甲基化可使其后的基因不能轉(zhuǎn)錄,甲基化可能阻礙轉(zhuǎn)錄因子與DNA特定部位的結(jié)合從而影響轉(zhuǎn)錄。如果用基因打靶的方法除去主要的DNA甲基化酶,小鼠的胚胎就不能正常發(fā)育而死亡,可見DNA的甲基化對基因表達調(diào)控是重要的。

由此可見,染色質(zhì)中的基因轉(zhuǎn)錄前先要有一個被激活的過程,但目前對激活機制還缺乏認識。

(三)真核基因表達以正性調(diào)控為主

真核RNA聚合酶對啟動子的親和力很低,基本上不依靠自身來起始轉(zhuǎn)錄,需要依賴多種激活蛋白的協(xié)同作用。真核基因調(diào)控中雖然也發(fā)現(xiàn)有負性調(diào)控組件,但其存在并不普遍;真核基因轉(zhuǎn)錄表達的調(diào)控蛋白也有起阻遏和激活作用或兼有兩種作用者,但總的是以激活蛋白的作用為主。即多數(shù)真核基因在沒有調(diào)控蛋白作用時是不轉(zhuǎn)錄的,需要表達時就要有激活的蛋白質(zhì)來促進轉(zhuǎn)錄。換言之:真核基因表達以正性調(diào)控為主導。

三、真核基因轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控

真核細胞的三種RNA聚合酶(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ)中,只有RNA聚合酶Ⅱ能轉(zhuǎn)錄生成mRNA,以下主要討論RNA聚合酶Ⅱ的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。

(一)順式作用組件(cisacting elements)

真核基因的順式調(diào)控組件是基因周圍能與特異轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合而影響轉(zhuǎn)錄的DNA序列。其中主要是起正性調(diào)控作用的順式作用組件,包括啟動子(promoter)、增強子(enhancer);近年又發(fā)現(xiàn)起負性調(diào)控作用的組件棗沉寂子(silencer)。

1.啟動子 與原核啟動子的含義相同,是指RNA聚合酶結(jié)合并起動轉(zhuǎn)錄的DNA序列。但真核同啟動子間不像原核那樣有明顯共同一致的序列,而且單靠RNA聚合酶難以結(jié)合DNA而起動轉(zhuǎn)錄,而是需要多種蛋白質(zhì)因子的相互協(xié)調(diào)作用,不同蛋白質(zhì)因子又能與不同DNA序列相互作用,不同基因轉(zhuǎn)錄起始及其調(diào)控所需的蛋白因子也不完全相同,因而不同啟動子序列也很不相同,要比原核更復雜、序列也更長。真核啟動子一般包括轉(zhuǎn)錄起始點及其上游約100-200bp序列,包含有若干具有獨立功能的DNA序列元件,每個元件約長7-30bp。最常見的哺乳類RNA聚合酶Ⅱ啟動子中的元件序列見表19-1。

表19-1 哺乳類RNA聚合酶Ⅱ啟動子中常見的元件

元件名稱共同序列結(jié)合的蛋白因子
名稱分子量結(jié)合DNA長度
TATAboxTATAAAATBP30,000~10bp
GC boxGGGCGGSP-1105,000~20bp
CAA boxGGCCAATCTCTF/NF160,000~22bp
OctamerATTTGCATOct-176,000~10bp
Oct-253,000~20bp
kBGGGACTTTCCNFkB44,000~10bp
ATFGTGACGTAFT?20bp

啟動子中的元件可以分為兩種:

①核心啟動子元件(core promoter element) 指RNA聚合酶起始轉(zhuǎn)錄所必需的最小的DNA序列,包括轉(zhuǎn)錄起始點及其上游-25/-30bp處的TATA盒。核心元件單獨起作用時只能確定轉(zhuǎn)錄起始位點和產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄。

②上游啟動子元件(upstream promoter element) 包括通常位于-70bp附近的CAAT盒和GC盒、以及距轉(zhuǎn)錄起始點更遠的上游元件。這些元件與相應的蛋白因子結(jié)合能提高或改變轉(zhuǎn)錄效率。不同基因具有不同的上游啟動子元件,其位置也不相同,這使得不同的基因表達分別有不同的調(diào)控。圖19-14以人金屬硫蛋白基因為例子,說明真核基因上游啟動子元件的組織情況和各元件相應結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子。

圖19-14 人金屬硫蛋白基因的調(diào)控區(qū)

2.增強子 是一種能夠提高轉(zhuǎn)錄效率的順式調(diào)控元件,最早是在SV40病毒中發(fā)現(xiàn)的長約200bp的一段DNA,可使旁側(cè)的基因轉(zhuǎn)錄提高100倍,其后在多種真核生物,甚至在原核生物中都發(fā)現(xiàn)了增強子。增強子通常占100-200bp長度,也和啟動子一樣由若干組件構(gòu)成,基本核心組件常為8-12bp,可以單拷貝或多拷貝串連形式存在。增強子的作用有以下特點:

①增強子提高同一條DNA鏈上基因轉(zhuǎn)錄效率,可以遠距離作用,通?删嚯x1-4kb、個別情況下離開所調(diào)控的基因30kb仍能發(fā)揮作用,而且在基因的上游或下游都能起作用。

②增強子作用與其序列的正反方向無關(guān),將增強子方向倒置依然能起作用。而將啟動子倒就不能起作用,可見增強子與啟動子是很不相同的。

③增強子要有啟動子才能發(fā)揮作用,沒有啟動子存在,增強子不能表現(xiàn)活性。但增強子對動子沒有嚴格的專一性,同一增強子可以影響不同類型啟動子的轉(zhuǎn)錄。例如當含有增強子的病毒基因組整合入宿主細胞基因組時,能夠增強整合區(qū)附近宿主某些基因的轉(zhuǎn)錄;當增強子隨某些染色體段落移位時,也能提高移到的新位置周圍基因的轉(zhuǎn)錄。使某些癌基因轉(zhuǎn)錄表達增強,可能是腫瘤發(fā)生的因素之一。

④增強子的作用機理雖然還不明確,但與其他順式調(diào)控元件一樣,必須與特定的蛋白質(zhì)因結(jié)合后才能發(fā)揮增強轉(zhuǎn)錄的作用。增強子一般具有組織或細胞特異性,許多增強子只在某些細胞或組織中表現(xiàn)活性,是由這些細胞或組織中具有的特異性蛋白質(zhì)因子所決定的。

3.沉寂子 最早在酵母中發(fā)現(xiàn),以后在T淋巴細胞的T抗原受體基因的轉(zhuǎn)錄和重排中證實這種負調(diào)控順式元件的存在。目前對這種在基因轉(zhuǎn)錄降低或關(guān)閉中起作用的序列研究還不多,但從已有的例子看到:沉寂子的作用可不受序列方向的影響,也能遠距離發(fā)揮作用,并可對異源基因的表達起作用。

(二)反式作用因子(transactingfactors)

以反式作用影響轉(zhuǎn)錄的因子可統(tǒng)稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors, TF)。RNA聚合酶是一種反式作用于轉(zhuǎn)錄的蛋白因子。在真核細胞中RNA聚合酶通常不能單獨發(fā)揮轉(zhuǎn)錄作用,而需要與其他轉(zhuǎn)錄因子共同協(xié)作。與RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ相應的轉(zhuǎn)錄因子分別稱為TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ,對TFⅡ研究最多。表19-2列出真核基因轉(zhuǎn)錄需要基本的TFⅡ。

表19-2 RNA聚合酶Ⅱ的基本轉(zhuǎn)錄因子

轉(zhuǎn)錄因子分子量(kD)功能
TBP30與TATA盒結(jié)合
TFⅡ-B33介導RNA聚合酶Ⅱ的結(jié)合
TFⅡ-F30,74解旋酶
TFⅡ-E34,37ATP酶
TFⅡ-H62,89解旋酶
TFⅡ-A12,19,35穩(wěn)定TFⅡ-D的結(jié)合
TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結(jié)合

以前認為與TATA盒結(jié)合的蛋白因子是TFⅡ-D,后來發(fā)現(xiàn)TFⅡ-D實際包括兩類成分:與TATA盒結(jié)合的蛋白是TBP(TATAbox binding protein),是唯一能識別TATA盒并與其結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子,是三種RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄時都需要的;其他稱為TBP相關(guān)因子(TBPassociated factors TAF),至少包括8種能與TBP緊密結(jié)合的因子。轉(zhuǎn)錄前先是TFⅡ-D與TATA盒結(jié)合;繼而TFⅡ-B以其C端與TBP-DNA復合體結(jié)合,其N端則能與RNA聚合酶Ⅱ親和結(jié)合,接著由兩個亞基組成的TFⅡ-F加入裝配,TFⅡ-F能與RNA聚合酶形成復合體,還具有依賴于ATP供給能量的DNA解旋酶活性,能解開前方的DNA雙螺旋,在轉(zhuǎn)錄鏈延伸中起作用。這樣,啟動子序列就與TFⅡ-D、B、F及RNA聚合酶Ⅱ結(jié)合形成一個“最低限度”能有轉(zhuǎn)錄功能基礎(chǔ)的轉(zhuǎn)錄前起始復合物(preintitiationcomplex, PIC),能轉(zhuǎn)錄mRNA。TFⅡ-H是多亞基蛋白復合體,具有依賴于ATP供給能量的DNA解旋酶活性,在轉(zhuǎn)錄鏈延伸中發(fā)揮作用;TFⅡ-E是兩個亞基組成的四聚體,不直接與DNA結(jié)合而可能是與TFⅡ-B聯(lián)系,能提高ATP酶的活性;TFⅡ-E和TFⅡ-H的加入就形成完整的轉(zhuǎn)錄復合體(圖19?5),能轉(zhuǎn)錄延伸生成長鏈RNA,TFⅡ-A能穩(wěn)定TFⅡ-D與TATA盒的結(jié)合,提高轉(zhuǎn)錄效率,但不是轉(zhuǎn)錄復合體一定需要的。

圖19-15 RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄復合體的形成示意圖

以上所述是典型的啟動子上轉(zhuǎn)錄復合體的形成,但有的真核啟動子不含TATA盒或不通過TATA盒開始轉(zhuǎn)錄。例如有的無TATA盒的啟動子是靠TFⅡ-I和TFⅡ-D共同組成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄起始復合體開始轉(zhuǎn)錄的。由此可以看到真核轉(zhuǎn)錄起始的復雜性。

不同基因由不同的上游啟動子元件組成,能與不同的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,這些轉(zhuǎn)錄因子通過與基礎(chǔ)的轉(zhuǎn)錄復合體作用而影響轉(zhuǎn)錄的效率。現(xiàn)在已經(jīng)發(fā)現(xiàn)有許多不同的轉(zhuǎn)錄因子,看到的現(xiàn)象是:同一DNA序列可被不同的蛋白因子所識別;能直接結(jié)合DNA序列的蛋白因子是少數(shù),但不同的蛋白因子間可以相互作用,因而多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子是通過蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間作用與DNA序列聯(lián)系并影響轉(zhuǎn)錄效率的(見圖19-16)。轉(zhuǎn)錄因子之間或轉(zhuǎn)錄因子與DNA的結(jié)合都會引起構(gòu)象的變化,從而影響轉(zhuǎn)錄的效率。

圖19-16 轉(zhuǎn)錄因子與轉(zhuǎn)錄復合體相互作用模式圖

圖19-16所示,作為蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄因子從功能上分析其結(jié)構(gòu)可包含有不同區(qū)域,①DNA結(jié)合域(DNa binding domain),多由60-100個氨基酸殘基組織的幾個亞區(qū)組成;②轉(zhuǎn)錄激活域(activating domain),常由30-100氨基酸殘基組成,這結(jié)構(gòu)域有富含酸性氨基酸、富含谷氨酰胺、富含脯氨酸等不同種類,以酸性結(jié)構(gòu)域最多見;③連接區(qū),即連接上兩個結(jié)構(gòu)域的部分。不與DNA直接結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子沒有DNA結(jié)合域,但能通過轉(zhuǎn)錄激活域直接或間接作用于轉(zhuǎn)錄復合體而影響轉(zhuǎn)錄效率。

與DNA結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子大多以二聚體形式起作用,與DNA結(jié)合的功能域常見有以下幾種:

圖19-17 HTH結(jié)構(gòu)及其與DNA的結(jié)合

①螺旋轉(zhuǎn)角螺旋(helixturnhelix, HTH)及螺旋-環(huán)-螺旋(helixloophelix,HLH) 這類結(jié)構(gòu)至少有兩個α螺旋,其間由短肽段形成的轉(zhuǎn)角或環(huán)連接,兩個這樣的motif結(jié)構(gòu)以二聚體形式相連,距離正好相當于DNA一個螺距(3.4nm),兩個α螺旋剛好分別嵌入DNA的深溝(圖19-17)。

圖19-18 蛋白質(zhì)的指結(jié)構(gòu)

②鋅指(zinc finger) 其結(jié)構(gòu)如圖19-18所示,每個重復的“指”狀結(jié)構(gòu)約含23個氨基酸殘基,鋅以4個配價鍵與4個半胱氨酸、或2個半胱氨酸和2個組氨酸相結(jié)合。整個蛋白質(zhì)分子可有2?個這樣的鋅指重復單位。每一個單位可以其指部伸入DNA雙螺旋的深溝,接觸5個核苷酸。例如與GC盒結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子SP1中就有連續(xù)的3個鋅指重復結(jié)構(gòu)。

③堿性-亮氨酸拉鏈(basic leucine zipper, bZIP),該結(jié)構(gòu)的特點是蛋白質(zhì)分子的肽鏈上每隔6個氨基酸就有一個亮氨酸殘基,結(jié)果就導致這些亮氨酸殘基都在α螺旋的同一個方向出現(xiàn)。兩個相同結(jié)構(gòu)的兩排亮氨酸殘基就能以疏水鍵結(jié)合成二聚體,該二聚體的另一端的肽段富含堿性氨基酸殘基,借其正電荷與DNA雙螺旋鏈上帶負電荷的磷酸基團結(jié)合。若不形成二聚體則對DNA的親和結(jié)合力明顯降低。在肝臟、小腸上皮、脂肪細胞和某些腦細胞中有稱為C/EBP家族的一大類蛋白質(zhì)能夠與CAAT盒和病毒增強子結(jié)合,其特征就是能形成bZIP二聚體結(jié)構(gòu)。

圖19-19 堿性亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)及其與DNA的結(jié)合

從上述可見:轉(zhuǎn)錄調(diào)控的實質(zhì)在于蛋白質(zhì)與DNA、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用,構(gòu)象的變化正是蛋白質(zhì)和核酸“活”的表現(xiàn)。但對生物大分子間的辨認、相互作用、結(jié)構(gòu)上的變化及其在生命活動中的意義,人們的認識和研究還只在起步階段,其中許多內(nèi)容甚至重要的規(guī)律我們可能至今還一無所知,有待于努力探索。

...
關(guān)于我們 - 聯(lián)系我們 -版權(quán)申明 -誠聘英才 - 網(wǎng)站地圖 - 醫(yī)學論壇 - 醫(yī)學博客 - 網(wǎng)絡課程 - 幫助
醫(yī)學全在線 版權(quán)所有© CopyRight 2006-2046, MED126.COM, All Rights Reserved
皖I(lǐng)CP備06007007號
百度大聯(lián)盟認證綠色會員可信網(wǎng)站 中網(wǎng)驗證