已經(jīng)證實幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,Hp)是引起慢性B型胃炎的主要原因,在十二指腸潰瘍病的發(fā)病機理中起重要作用,與胃癌的關系也越來越受到學者們的重視。診斷Hp感染的方法已有很多,其缺點是不夠敏感,因此,需要一種快速、可靠,具有高度敏感性的檢測方法。聚合酶鏈反應(polymerase chain reaction,PCR)用于檢測Hp感染國外已有報道,國內也有人用此方法檢測唾液中的Hp。本文報道了用PCR技術從胃粘膜活組織中檢測Hp,并探討該方法在Hp感染的診斷和在評價治療后根除效果中的意義。
1 材料和方法
1.1 PCR方法的建立
1.1.1 細菌菌株和培養(yǎng)
Hp標準菌株NCTC11637.NCTC11848及空腸彎曲桿菌NCTC11351來自倫敦國家標準培養(yǎng)物收藏中心(National Collectionof Type Culture),由本院傳染科保存并提供。50株Hp臨床菌株來自因胃腸癥狀在本院行胃鏡檢查的病人,取胃竇活組織標本一塊,勻漿后接種于含萬古毒素10μg/ml,兩性毒素B2μg/ml甲氧芐淀(TMP)5μg/ml的7%羊血瓊脂培養(yǎng)基,于37℃微需氧條件培養(yǎng)3d~7d。根據(jù)菌落形態(tài)、革蘭染色,以及尿素酶、過氧化氫酶、氧化酶試驗陽性進行細菌鑒定。金黃色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肺炎球菌、綠膿桿菌、大腸桿菌、變形桿菌、不動桿菌、克雷白肺炎桿菌、傷寒桿菌、陰溝桿菌、弗氏痢疾桿菌及胎兒彎曲桿菌由本院臨床藥理研究所提供。
1.1.2 細菌DNA的提取
Hp菌種轉種于含7%羊血的瓊脂培養(yǎng)基,37℃微氧條件培養(yǎng)3d,非Hp菌種按常規(guī)方法轉種培養(yǎng)24~48h后收獲。以氯化芐方法提取細菌DNA,所用試劑按文獻相應減少。于分光光度計上測定HpNCTC 11637 DNA 的OD260及OD280,計算DNA濃度。
1.1.3 引物的選擇
CP1/P2引物來自Hp16SrRNA基因,參考Hoshiua等提供的序列,由中國科學院遺傳所合成并純化。CP1:5"—GCGCAATCAGCGTCAGGTAATG—3"CP2:5"—GCTAAGAGATCAGCCTATGTCC—3",擴增片段長度500bp。
1.1.4 PCR擴增Hp16SrRNA片段
采用50μl,擴增體系:10mmol/Ltris·HCI(Ph8.3);50mmol/LKCL;1.5MMOL/LgCI2;0.01%明膠;各200umol/LdATP、dcTP、dTTp、dGTP(Boehringer公司產(chǎn)品);各0.5μmcpl。CP2引物;1.www.med126.com25UTaqDNA聚合酶(中國科學院遺傳所產(chǎn)品);1μl模板DNA。拉增反應在Perkin-Elmer公司的DNa Thermal Cycler480上進行:96℃5min,1個循環(huán);94℃1min變性,55℃1min退火,72℃1.5min延伸,35個循環(huán);最后于72℃繼續(xù)延伸10min。反應中以HpNCTC11637做陽性對照,以去離子水代替模板DNA做陰性對照。擴增產(chǎn)物以1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。
1.2 PCR檢測胃粘膜活組織標本中的Hp
96名因上胃腸癥狀行胃鏡檢查的病人及25名因Hp感染經(jīng)抗生素根除治療后復查胃鏡的病人,于胃竇部取粘膜活組織,分別做尿素酶試驗(蘭州軍醫(yī)學校生產(chǎn)試劑盒),細菌培養(yǎng)及Warthin-Starry銀染檢查(由本科專職病理醫(yī)師完成)。另取胃竇粘膜活組織村本一塊,置500μlTE(10mmol/LTris.HCI.1mmol/LEDTA)(pH8.0)緩沖液中研碎,加10%SD30μl蛋白酶K(20mg/ml)3ml,55℃消化1h,以等體積苯酚—氯仿提取模板DNA用于PCR檢測,標本處理程中以緩沖液做陰性對照。
統(tǒng)計學處理采用配對四格表資料的X2檢驗。
2 結果
2.1 PCR方法的敏感性
采用10倍系列稀釋的HpNCTC 11637DNA檢測PCR反應的敏感性。1μg~0.1pg的DNA擴增后在1%瓊脂糖凝膠上均產(chǎn)生可見的條帶,檢出的最低Hp DNA量為0.1pg,相當于100個細菌細胞。
2.2 PCR的特異性
引物CP1/CP2對Hp標準菌株NCTC 11637、NCTC11848及50株臨床分離的Hp菌株擴增后均可產(chǎn)生500bp預期片段,而對13株非Hp菌株,包括金黃色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肺炎球菌、綠膿桿菌、大腸桿菌、變形桿菌、不動桿菌、克雷白肺炎桿菌、傷寒桿菌、陰溝桿菌、弗氏痢疾桿菌、胎兒變曲桿菌及空腸變曲桿菌NCTC11351均呈陰性反應;對無Hp感染的人胃粘膜也呈陰性反應。
2.3 PCR與常規(guī)檢測方法的比較
①PCR對初診病人Hp感染的診斷:用PCR方示檢測了96名因上胃腸癥狀前次行胃鏡和胃粘膜活組織檢查的病人,并與尿素酶試驗、細菌培養(yǎng)和Warthin-Starry銀染色等常規(guī)檢測方法進行了比較(表1,2)。在四項檢查方法中,PCR檢出的陽性病人數(shù)最多,與尿素酶試驗和細菌培養(yǎng)結果比較有顯著性差異(P<0.05)。PCR方法還檢出2例上述三項常規(guī)檢方法均為陰性的Hp感染者。所有細菌培養(yǎng)或銀染色陽性的病人,用PCR檢測均呈陽性。②PCR對藥的物治療后Hp是否根除的評價:用PCR方法檢測了25名十二指腸潰瘍病伴Hp感染經(jīng)不同抗生素方案治療的病人,并與尿素酶試驗,細菌培養(yǎng)及銀染色方法比較(表3)。發(fā)現(xiàn)其中20名病人常規(guī)三項檢測方法均為陰性,認為Hp已被根除,然而用PCR方法檢測卻發(fā)現(xiàn)在這20名所謂Hp已被根除的病人中有4例Hp仍為陽性,從而表明藥物治療并未使這4名病人感染的Hp徹底根除。對這4名病人中的3名于停藥后5月~6月復查,發(fā)現(xiàn)2名病人尿素酶試驗、細菌培養(yǎng)及銀染色均轉為陽性。證明PCR能檢出治療后用常規(guī)方法治能檢出、而實際上仍然存在的少量Hp。
表1 胃粘膜活組織4種方法檢測Hppayment-defi.com的結果
PCR | 尿素酶 | 細菌培養(yǎng) | 銀染色 | |||
陽性 | 陰性 | 陽性 | 陰性 | 陽性 | 陰性 | |
陽性 | 58 | 7 | 56 | 9 | 63 | 2 |
陰性 | 1 | 30 | 0 | 31 | 0 | 31 |
表2 PCR與常規(guī)方法陽性檢出率的比較
檢測方法 | n | 陽性數(shù) | 百分數(shù)(%) |
PCR | 96 | 65 | 67.7 |
尿素酶試驗 | 96 | 59 | 61.5a |
細菌培養(yǎng) | 96 | 56 | 58.3a |
銀染色 | 96 | 63 | 65.6 |
aP<0.05,νsPCR
表3 十二指腸潰瘍伴Hp感染治療后檢測結果
n | 尿素酶試驗 | 細菌培養(yǎng) | 銀染色 | PCR |
16 | - | - | - | - |
4 | + | + | + | + |
1 | - | - | + | + |
4 | - | - | - | + |
3 討論
自從1983年Warren和Marshall報道從人胃粘膜中成功地分離出Hp以后,不少學者致力于Hp診斷的研究,旨在建立一種快速、簡便,具有高度敏感性和特異性的診斷方法。當前,臨床上應用最廣泛的仍是通過胃鏡取胃粘膜活組織做尿素酶試驗、細菌培養(yǎng)及組織學染色(Warthin-Starry銀染色)后做顯微鏡檢查。尿素酶試驗快速、簡便,但常有假陽性和假陰性。細菌培養(yǎng)則要盡可能縮短接種前標本的轉運時間,細菌生長緩慢且需要特殊的培養(yǎng)條件,球形Hp則不易培養(yǎng)成活。銀染色后做顯微鏡檢查雖然敏感性和特異性均高,但操作較煩瑣,要求技術熟練程度高,且費時,價格較貴。非侵入性的方法如13C或14C呼氣試驗雖具有快速、可靠、無痛苦的優(yōu)點,但費用較高,且接觸同位素。血清抗體的檢測則主要用于流行病學研究。作者的PCR方法與上述傳統(tǒng)檢測方法比較,不僅快速、簡便,而且證實引物CP1/CP2對Hp的擴增是特異的,而對其它細菌和無Hp感染的人胃粘膜則無擴增產(chǎn)物出現(xiàn)。該方法只需從胃粘膜活檢標本中粗提模板DNA,其檢出的最小Hp DNA量為0.1pg,相當于100個細菌細胞,與文獻報道結果相似。
本研究中將PCR技要用于Hp感染的診斷,并與傳統(tǒng)的尿素酶試驗、細菌培養(yǎng)及銀染色方法進行了比較,9例細菌培養(yǎng)陰性及2例銀染色陰性者,用PCR檢測則全部為陽性。PCR與尿素酶試驗及細菌培養(yǎng)的結果比較有顯著性差異,而與銀染色比較差異尚無顯著性,可能由于受檢樣本數(shù)不夠。以上結果表明,PCR技術確實較常規(guī)檢測方法更為敏感,可以檢出常規(guī)方法不能檢出的Hp,是Hp感染的最敏感的方法。這與國外文獻的結論一致。
本研究中將PCR技術用于抗生素治療后檢測Hp是否被根除,發(fā)現(xiàn)20例3項常規(guī)檢測方法均為陰性認為Hp已被根除的患者,用PCR方法檢測證實其中4例Hp仍為陽性。說明藥物治療并未使這4名病人感染的Hp徹底根除,只是細菌數(shù)量減少,用常規(guī)檢查方法難以檢出。對其中3名治療后僅PCR呈陽性的病人的隨訪中證實,2名病人于停藥后5個月和6個月時尿素酶試驗、細菌培養(yǎng)及銀染色均轉為陽性,表明PCR用于評價藥物治療后Hp是否被根除,可以及早發(fā)現(xiàn)治療不徹底,且在短期內感染可能復發(fā)的患者,從而指導繼續(xù)藥物治療,防止同一株Hp感染的復發(fā)。