（二)近交可將群體分離為不同基因型的品系（Splitting of the Population into Lines of Different Gentypes)
原始種群經(jīng)過近交分為若干近交系，在不同等位基因的不同位點(diǎn)上變?yōu)榧兒献�。原始種群的小鼠兄妹交配連續(xù)20代之后分離出兩支等位基因A和a的近交品系：
1．等位基因A的品系：只生產(chǎn)野鼠色后代。
2．等位基因a的品系：只生產(chǎn)黑色后代。
近交品系動物的獲得，可使原來雜合子的動物增加純合性（Homozygosity)，從而提高基因型的穩(wěn)定性，獲得想要的品系，實(shí)驗(yàn)者可以從動物的特定性狀中進(jìn)行選擇。
（三)近交可引起近交衰退（Inbreeding Depression)
親緣接近的交配所產(chǎn)生的后代常常會出現(xiàn)生長、成活、生育、抗病、適應(yīng)環(huán)境等能力的減退，這種現(xiàn)象稱之為近交衰退，如何克服和解決這個問題，是培育近交系動物的關(guān)鍵所在。由于近交衰退的緣故，從一個供繁殖的種群培育和建立一個近交系時，往往需要從雜交群或幾個近交系開始才能成功，而且的近交幾代后，有些系可以因生育或生活率低而斷絕；留下的受近交衰退影響較小的后代有些可以維持下來，而另外的也可能最后被淘汰。也由于同樣的原因，過去建立的某些近交系，現(xiàn)在只有某些亞系還仍然存在，有些不能全部存活，甚至難以維持。
近交衰退發(fā)生的原因是多方面的，從遺傳學(xué)的角度解釋主要有兩點(diǎn)：
1．有害的隱性基因的暴露。一般病態(tài)的突變基因絕大多數(shù)都是隱性的，所以處于雜合狀態(tài)時是不表現(xiàn)出病態(tài)或不利的性狀。這些有害基因的作用可被顯性的雜合子等位基因所掩蓋，但經(jīng)過一段近親繁殖，純合的基因（純合子)比例漸漸增多，于是有害的隱性基因相遇成為純合子而顯出作用，出現(xiàn)了不利的性狀，對個體的生長發(fā)育、生活和生育等產(chǎn)生明顯的不利影響。例如雜種動物所帶有的不育的隱性基因往往被其顯性的等位基因所掩蓋，而不表達(dá)其不育的性狀，但由于純育，動物的純合性逐漸增高，不育的現(xiàn)象也就表現(xiàn)出來了。
2．多基因平衡的破壞。個體的發(fā)育受多個基因共同作用的影響，雖然其中每個基因的作用效應(yīng)微小。對環(huán)境適應(yīng)較好的野生或雜交動物，由于自然選擇的作用有利于保存那些生物適應(yīng)能力較強(qiáng)的基因組合具有平衡的多基因系統(tǒng)，近交繁殖往往會破壞這個平衡，造成個體發(fā)育的不穩(wěn)定。醫(yī)學(xué).全在線payment-defi.com
近交衰退往往在近交培養(yǎng)過程中的最初若干世代中表現(xiàn)出來，以后經(jīng)過一定的人工選擇，帶有純合有害基因的動物被逐漸淘汰，或者由于無意識地保留了一小部分的雜合性，經(jīng)過5～10代左右的培育繁殖，后代中生育與生活力可以逐漸穩(wěn)定，不再下降。
由于近交系動物是采用近親繁殖方式，因此容易引起生活力的降低、生長繁殖力退化、抗病力降低等近交衰退變化，為了防止這些問題產(chǎn)生，應(yīng)注意如下幾點(diǎn)：
1．為防止種群傳代終斷，可采用回交方式（即父×女或母×子)而不計(jì)算近交代數(shù)，這樣可以維持種群不致在繁殖中終斷。
2．飼料營養(yǎng)的保證很重要，在一般傳代至5～7代時會出現(xiàn)生命力下降，生長繁殖退化，或出現(xiàn)產(chǎn)仔畸形等情況，因此應(yīng)在飼料中適當(dāng)增加營養(yǎng)成分以保證子代生長發(fā)育正常。
3．在傳代中注意檢查子代的情況選優(yōu)去劣，選擇體質(zhì)健康、生殖力旺盛的后代而不能選擇體弱繁殖力差的動物。
4．近交到6～7代時，可出現(xiàn)致死的有害基因，而且這種致死基因隨近交代數(shù)增加而不斷升高，可引起個體死亡，為此，培育近交品系，開始不必用同窩兄妹交配，用同父異母，或同母異父的兄妹交配，如待近交品系建立后再改變致死基因則很困難。
