醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)教案
第 4 次課 授課時(shí)間:2009年9月22-25日
課程名稱 | 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué) | 年級(jí) | 2007 | 專業(yè)、層次 | 臨床醫(yī)學(xué)、兒科、藥學(xué)、中藥學(xué)、耳鼻喉專業(yè) | ||||||
授課教師 | 李娟 | 職稱 | 講師 | 課型(大、小) | 大 | 學(xué)時(shí) | 2 | ||||
授課題目(章、節(jié)) | 第七章 基因組學(xué)及相關(guān)組學(xué)醫(yī).學(xué)全在線 | ||||||||||
基本教材及主要參考書 | 藥立波 主編. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)(第3版). 北京:人民衛(wèi)生出版社,2008 馮作化 主編. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué). 北京:人民衛(wèi)生出版社,2001 | ||||||||||
教學(xué)目的與要求: 目的:理解和掌握基因組學(xué)、功能基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。理解和掌握人類基因組計(jì)劃研究的主要內(nèi)容。理解和掌握基因表達(dá)譜的研究方法。理解和掌握蛋白質(zhì)組學(xué)的研究技術(shù)方法。 要求: 1. 基因組學(xué)、功能基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。 2. 人類基因組計(jì)劃研究的主要內(nèi)容。 3. 基因表達(dá)譜的研究方法。 4. 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究技術(shù)方法。 | |||||||||||
教學(xué)內(nèi)容與時(shí)間安排、教學(xué)方法: 內(nèi)容: 1. 基因組學(xué)、功能基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。 2. 人類基因組計(jì)劃研究的主要內(nèi)容。 3. 人類基因組計(jì)劃在醫(yī)學(xué)中的意義 4. 基因表達(dá)譜的研究 5. 其他功能基因組學(xué)研究技術(shù)方法 6. 蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法 7. 蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫及蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用 方法:盡量使用圖片簡(jiǎn)圖加深感性認(rèn)識(shí),總結(jié)對(duì)比增強(qiáng)辨識(shí)力,動(dòng)畫演示有助于理解。布置一些內(nèi)容自學(xué),嘗試課堂提問或討論。 | |||||||||||
教學(xué)重點(diǎn)及如何突出重點(diǎn)、難點(diǎn)及如何突破難點(diǎn): 重點(diǎn):基因組學(xué)、功能基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念;人類基因組計(jì)劃研究的主要內(nèi)容;基因表達(dá)譜和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究技術(shù)方法。 對(duì)于重點(diǎn)內(nèi)容,教學(xué)過程中應(yīng)注意著重強(qiáng)調(diào),以提醒學(xué)生注意。 難點(diǎn):人類基因組計(jì)劃研究的主要內(nèi)容;基因表達(dá)譜和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究技術(shù)方法。 有關(guān)基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究的技術(shù)方法,由于感性認(rèn)識(shí)缺乏,理解起來較困難,應(yīng)多使用圖片和動(dòng)畫以助學(xué)生理解。 | |||||||||||
教研室審閱意見: 教研室主任簽名: 年 月 日 | |||||||||||
基本內(nèi)容 | 教學(xué)手段 | 課堂設(shè)計(jì)和時(shí)間安排 | |||||||||
第七章 基因組學(xué)及相關(guān)組學(xué) ―――――――――――――――――― | (★-重點(diǎn),☆-難點(diǎn)) | ||||||||||
第一節(jié) 基因組學(xué) 基因組學(xué)(genomics)是指對(duì)整個(gè)基因組的結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系以及基因之間相互作用進(jìn)行探索的一門科學(xué)。 人類基因組計(jì)劃的主要研究?jī)?nèi)容 人類基因組計(jì)劃(human genome project,HGP)最初由美國(guó)科學(xué)家于20世紀(jì)80年代中期提出,其目標(biāo)是用15年時(shí)間,測(cè)定出人類基因組DNA的全部堿基序列。 HGP最終需要完成四張圖譜:遺傳圖、物理圖、轉(zhuǎn)錄圖和序列圖。 (一)遺傳圖譜 以具有遺傳多態(tài)性的遺傳標(biāo)記作為“位標(biāo)”,以遺傳學(xué)距離作為“圖距”所作出的基因組圖譜。(二)物理圖譜 物理圖譜(physical map)是以一段已知堿基序列的DNA片段(堿基序列具惟一性)作為“位標(biāo)”,以DNA分子的實(shí)際長(zhǎng)度作為距離所作出的基因組圖譜。 (三)轉(zhuǎn)錄圖譜 轉(zhuǎn)錄圖譜(transcriptional map)是以已知的基因表達(dá)序列作為“位標(biāo)”,以DNA分子的實(shí)際長(zhǎng)度作為距離所作出的基因組圖,即基因表達(dá)序列圖。 (四)序列圖譜 序列圖譜(sequence map)即指完整的人類基因組DNA堿基序列圖譜。 人類基因組全部DNA堿基序列的測(cè)序工作于2003年4月基本結(jié)束;2006年4月,最后一個(gè)染色體的測(cè)序工作完成。 | 討論 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫 | ★概念。 ☆結(jié)合圖示講解并強(qiáng)調(diào):人類基因組計(jì)劃研究的主要內(nèi)容:遺傳圖譜、物理圖譜、轉(zhuǎn)錄圖譜、序列圖譜。
――第1節(jié)課結(jié)束――― | |||||||||
人類基因組計(jì)劃在醫(yī)學(xué)中的意義 人類基因組計(jì)劃在醫(yī)學(xué)中的意義主要體現(xiàn)在: 1、通過對(duì)基因結(jié)構(gòu)與功能的研究,推動(dòng)了在分子水平上對(duì)各種生理功能的認(rèn)識(shí)。 2、推動(dòng)了基因組信息與疾病易感性的研究。 3、促進(jìn)了對(duì)癌癥的研究。 4、促進(jìn)了對(duì)疾病遺傳學(xué)背景的研究。 5、促進(jìn)了藥物基因組學(xué)的研究。 | 討論 | 講解:基因結(jié)構(gòu)與功能的研究;與疾病易感性的研究;與癌癥的研究;疾病的遺傳學(xué)背景;藥物基因組學(xué)。
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第二節(jié) 后基因組學(xué) 功能基因組學(xué)研究基因組中所有基因的功能,它從整體水平上研究某種組織或細(xì)胞在同一時(shí)間或同一條件下所表達(dá)的基因的種類、數(shù)量及功能,或同一細(xì)胞在不同狀態(tài)下基因表達(dá)的差異。 (一)基因表達(dá)譜的研究 1、基因芯片技術(shù)(DNA chip): 即將大量已知序列的cDNA探針固定于支持物上,然后與樣品所表達(dá)的全部cDNA進(jìn)行雜交。 2、基因表達(dá)分析系統(tǒng)(SAGE): 將細(xì)胞內(nèi)所表達(dá)的mRNA逆轉(zhuǎn)錄為雙鏈cDNA后,獲取不同cDNA的序列標(biāo)簽并進(jìn)行連接和擴(kuò)增,再分析其表達(dá)模式圖。 3、差異顯示PCR(DDRT-PCR): 將若干種不同mRNA的5´-端引物與3´-錨定引物隨機(jī)組合后進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,然后分析其產(chǎn)物的種類和表達(dá)量。 4、消減雜交法(SH): 即將對(duì)照組的mRNA或cDNA與實(shí)驗(yàn)組的cDNA或mRNA進(jìn)行雜交,去除雜交體中所含對(duì)照組的部分即為實(shí)驗(yàn)組中獨(dú)特的表達(dá)成分。 (二)基因產(chǎn)物-蛋白質(zhì)功能的研究 (三)基因組多樣性的研究 (四)疾病相關(guān)基因的再測(cè)序 (五)尋找人類基因共同變異型 (六)基因組功能的注釋 | 討論 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫 | 結(jié)合圖示講解并強(qiáng)調(diào):基因芯片技術(shù);基因表達(dá)分析系統(tǒng);差異顯示PCR;消減雜交法。
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第一節(jié) 蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)是指在亞細(xì)胞、細(xì)胞、組織或器管的整體水平上,研究其蛋白質(zhì)組成及其活動(dòng)規(guī)律的一門科學(xué)。 雙向電泳分離技術(shù)、生物信息學(xué)處理技術(shù)以及蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)被稱為蛋白質(zhì)組研究的三大技術(shù)。 雙向電泳技術(shù)利用蛋白質(zhì)分子所帶電荷及分子量的不同,將混合的蛋白質(zhì)樣品首先置于IPG膠上進(jìn)行等電聚焦(IEF)分離,然后再置于變性聚丙烯酰胺凝膠(SDS-PAGE)上進(jìn)行分離。此法通?煞蛛x到1000~10000種不同的蛋白質(zhì)。 | 討論 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫 | ★概念 ★☆結(jié)合圖示講解并強(qiáng)調(diào):雙向電泳;生物質(zhì)譜與蛋白質(zhì)鑒定。
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蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫 | 討論 | 講解:Swiss-Prot/TrEMBL蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫。
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蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用 | 討論 | 講解:比較蛋白質(zhì)組學(xué)、功能蛋白質(zhì)組學(xué)和疾病蛋白質(zhì)組學(xué)。
―――第2節(jié)課結(jié)束――― | |||||||||
小 結(jié) | 人類基因組計(jì)劃研究的主要內(nèi)容。 基因表達(dá)譜和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究技術(shù)方法。
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復(fù) 習(xí) 思 考 題 、 作 業(yè) 題 | 1. 什么是基因組學(xué)?什么是功能基因組學(xué)?什么是蛋白質(zhì)組學(xué)? 2. 人類基因組計(jì)劃研究的主要內(nèi)容包括哪些? 3. 人類基因組計(jì)劃在醫(yī)學(xué)上有哪些意義? 4. 哪些醫(yī).學(xué)全在線payment-defi.com技術(shù)方法可應(yīng)用于基因表達(dá)譜的研究? 5. 功能基因組學(xué)的研究包括哪些方面? 6. 什么是基因組多態(tài)性?什么是單核苷酸多態(tài)性? 7. 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究技術(shù)有哪些? 8. 常用的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫有哪些? 9. 蛋白質(zhì)組學(xué)可應(yīng)用于哪些方面? | ||||||||||
下 次 課 預(yù) 習(xí) 要 點(diǎn) | 1. 細(xì)胞周期的概念和時(shí)相。 2. 主要的細(xì)胞周期蛋白與細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶復(fù)合體。 3. 細(xì)胞分化、胚胎干細(xì)胞的概念。 4. 細(xì)胞分化的特點(diǎn)。 5. p27蛋白、E2F對(duì)細(xì)胞周期的影響。 | ||||||||||
實(shí) 施 情 況 及 分 析 | |||||||||||