1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 主要試劑:限制性核酸內(nèi)切酶XhoⅠ、NdeⅠ、XbaⅠ和T DNA連接酶購自北京賽百盛基因技術(shù)有限公司;編碼YARA的兩條寡核苷酸鏈由北京賽百盛基因技術(shù)有限公司合成,序列為正義鏈:5′TATGTATGCCCGCGCGGCGGCGCGACAAGCGCGAG CCC3′(38 bp),反義鏈:5′TCGAGGGCTCGCGCTTGTCGCGCCGCCGCGCGGGCATACA3′(40 bp),100 bp DNA Ladder購自北京華美生物工程有限公司;IPTG(isopropyl βDthiogalactoside)購自美國Promega公司;Ni2+NTA 樹脂填料購自美國QIAGEN公司;預(yù)染蛋白質(zhì)相對分子量標(biāo)準(zhǔn)購自江蘇碧云天有限公司;兔抗Histag多克隆抗體購自Santa Cruz公司;Western blot試劑盒購自美國KPL公司;ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒購自Amersham Pharmacia Biotech公司。
1.1.2 質(zhì)粒與菌株:pET15b,E.coli BL21(DE3)購自美國Novagen公司,E.coli DH5α和pET15bPEP1EGFP原核表達載體由鄖陽醫(yī)學(xué)院附屬人民醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)研究所提供。
1.1.3 主要儀器:投射式紫外分析儀(EF90A,上海),凝膠成像系統(tǒng)(Touching 955 gel document system,上海),臺式高速冷凍離心機(Hettich,Universal 32 R,德國),超聲波細(xì)胞粉碎儀(JY983D,寧波),超速冷凍離心機(Hitachi,Himac CP80MX,日本),核酸蛋白檢測儀(HD2004B,上海),恒流泵(HL2,上海),紫外分光光度計(Cecil 2041,英國)醫(yī).學(xué).全.在.線payment-defi.com。
1.2 方法
1.2.1 pET15bYARAEGFP的構(gòu)建:將pET15bPEP1EGFP分別用XhoⅠ、NdeⅠ酶切,使之去掉編碼PEP1的DNA序列,酶切產(chǎn)物用1%低熔點瓊脂糖凝膠電泳,然后在紫外燈下切取含酶切大片段的凝膠,65 ℃水浴10 min融化凝膠,用酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,沉淀用10 μL消毒三蒸水溶解。將編碼YARA的兩條寡核苷酸鏈等摩爾混合后煮沸變性,再逐漸降溫至室溫復(fù)性,形成兩端分別為XhoⅠ和NdeⅠ粘性末端的雙鏈DNA,然后與線性化的酶切大片段用T4 DNA連接酶連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)DH5α大腸桿菌,擴增后提取重組質(zhì)粒并用XhoⅠ和XbaⅠ酶切鑒定,若出現(xiàn)137 bp片段,說明編碼YARA的DNA片段插入到酶切后的質(zhì)粒中,成功插入了編碼YARA序列的質(zhì)粒命名為pET15bYARAEGFP(圖1)。將重組正確的質(zhì)粒送北京華大中生科技有限公司進行DNA測序。
1.2.2 pET15bYARAEGFP轉(zhuǎn)化E.coli BL21(DE3)和YARAEGFP融合蛋白的誘導(dǎo)表達:從-80 ℃超低溫冰箱取出100 μL E.coli BL21(DE3),取1 μL pET15bYARAEGFP質(zhì)粒加入菌液中,輕彈管壁,使其均勻分布,置冰上30 min,42 ℃水浴中熱休克90 s后,迅速置冰浴冷卻2 min。取1 mL SOC培養(yǎng)基與轉(zhuǎn)化菌液混勻后加入10 mL離心管,將其置37 ℃水浴搖床中振搖(150 r/min)1 h。轉(zhuǎn)化的菌液鋪于含100 μg/mL Ampicillin的LB平板上,置37 ℃細(xì)菌培養(yǎng)箱中過夜,挑取單克隆接種于5 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃振搖培養(yǎng)過夜,然后用新鮮培養(yǎng)基按1∶50比例稀釋,擴大培養(yǎng)至OD600≈0.8時加入終濃度為1.0 mmol/L的IPTG,30 ℃培養(yǎng)12 h以誘導(dǎo)目的蛋白的表達。4 ℃、5 000 r/min離心5 min,收集細(xì)菌沉淀,1×PBS漂洗3次,加6倍柱體積的結(jié)合緩沖液(5 mmol/L Imidazole,500 mmol/L NaCl,20 mmol/L Tris·HCl,pH 7.9)重懸菌體。然后冰浴超聲破菌(520 W,30 min),將菌液置超速冷凍離心機中20 000 r/min離心10 min,則融合蛋白以天然、可溶的形式存在于上清中。
1.2.3 YARAEGFP融合蛋白的純化:pET15b作為載體所表達的基因工程重組蛋白在其N端帶有一個由6個組氨酸組成的“標(biāo)簽”(Histag),可用Ni2+NTA樹脂進行親和層析純化。收集超離后的上清,將其轉(zhuǎn)入裝有Ni2+NTA樹脂的層析柱中,靜置4 h,以便6個組氨酸標(biāo)簽與填料中Ni2+充分結(jié)合。用10倍柱體積的漂洗緩沖液(30 mmol/L Imidazole,500 mmol/L NaCl,20 mmol/L Tris·HCl,pH 7.9)過柱以洗去未結(jié)合的雜蛋白,然后用5倍柱體積的洗脫緩沖液(500 mmol/L Imidazole,500 mmol/L NaCl,20 mmol/L Tris·HCl,pH 7.9)洗柱并收集洗脫下來的目的蛋白YARAEGFP。目的蛋白用生物半透膜透析48 h以充分脫鹽(透析液為 pH 7.4的 PBS),透析后的融合蛋白用0.45 μm的濾膜除菌后,用1.5 mL Eppendorf 管分裝,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/P>
1.2.4 YARAEGFP融合蛋白的定性:制備12%分離膠和5%濃縮膠,分別取含有目的蛋白的細(xì)菌裂解上清(純化前)和收集的峰值洗脫液(純化后)行SDSPAGE 電泳,凝膠用考馬斯亮藍R250 染色40 min后,用SDSPAGE凝膠脫色液放在水平搖床上振搖脫色至本底無色為止。融合蛋白經(jīng)SDSPAGE分離后行Western blot以進一步證實純化產(chǎn)物。將凝膠電轉(zhuǎn)印至硝酸纖維素膜上,加10 mL封閉液封閉2 h阻斷非特異性結(jié)合部位,加入1∶1 000稀釋的一抗(兔抗組氨酸多克隆抗體)10 μL, 室溫振搖孵育過夜。Western blot漂洗液漂洗4次,每次8 min。加10 mL封閉液及按1∶1 000 稀釋的羊抗兔二抗10 μL,水平搖床孵育2 h 后漂洗4次,每次8 min。用三蒸水沖洗一遍硝酸纖維素膜,放入干凈的平皿中加入1 mL化學(xué)發(fā)光劑ECL,置入暗室用X光膠片曝光,然后顯影,定影。醫(yī).學(xué).全.在.線payment-defi.com