(五)顯示(Visualization)
顯示又可稱為檢測系統(tǒng)(Detection system)。根據(jù)核酸探針標(biāo)記物的種類分別進(jìn)行放射自顯影或利用酶檢測系統(tǒng)進(jìn)行不同顯色處理(詳見本章 第二節(jié) )。
細(xì)胞或組織的原位雜交切片在顯示后均可進(jìn)行半定量的測定,如放射自顯影可利用人工或計算機(jī)輔助的圖象分析檢測儀(computer – assisted image analysis)檢測銀粒的數(shù)量和分布的差異。非放射性核酸探針雜交的細(xì)胞或組織可利用酶檢測系統(tǒng)顯色,然后利用顯微分光光度計或圖像分析儀對不同類型和數(shù)量的核酸的顯色強(qiáng)度進(jìn)行檢測。但利用ISHH做半定量測定必須注意嚴(yán)格控制實驗的同一條件,切片的厚度和核酸的保存量如取材固定的間隔時間等。如為放射自顯影,核乳膠膜的厚度與稀釋度等必須保持一致。
。)對照實驗和ISHH結(jié)果的判斷
和其它實驗方法一樣,并非ISHH的任何陽性信號都是特異性的,故必須同時有對照試驗以證明其特異性。對照試驗的設(shè)置須根據(jù)核酸探針和靶核苷酸的種類和現(xiàn)有的可能條件去選定,常用的對照試驗有下列幾種(表20-1)。
表20-1 ISHH對照試驗一覽表
核乳膠或非放射性檢測系統(tǒng)對照試驗 |
Northern 或Southern印跡雜交法* |
ISHH與免疫細(xì)胞化學(xué)結(jié)合* |
應(yīng)用多種不同的核苷酸探針與同一靶核酸進(jìn)行雜交 |
將cDNA或cRNA探針進(jìn)行預(yù)雜交(吸收試驗)* |
與非特異性(載體)序列和不相關(guān)探針雜交(置換試驗) |
將切片應(yīng)用RNA酶或DNA酶進(jìn)行預(yù)處理后雜交* |
應(yīng)用同義RNA探針(Sense probe)進(jìn)行雜交* |
以不加核酸探針雜交液進(jìn)行雜交(空白試驗) |
組織對照用已知確定為陽性或陰性組織進(jìn)行ISHH對照 |
應(yīng)用未標(biāo)記探針做ISHH,進(jìn)行對照 |
從理論上講,對照試驗設(shè)置愈多其靶核苷酸特異性確定愈可靠,但現(xiàn)實是不可能的。因此,在上述對照試驗中應(yīng)任選設(shè)至少3~4種用以證實ISHH結(jié)果的可靠性。在上述試驗中,標(biāo)明*者為比較可靠的對照試驗。①Northern 和Southern印跡雜交法證明的方式和用Western印跡法檢測抗體(蛋白質(zhì))的特異性一樣,是比較可靠的。②如果具備相當(dāng)?shù)拿庖呓M化抗血清,可用結(jié)合的免疫組織化學(xué)和ISHH法從蛋白質(zhì)(或多肽)水平和轉(zhuǎn)錄水平在相鄰切片或同一切片中證明同一種多肽和相應(yīng)mRNA共存于同一細(xì)胞中。③預(yù)先將切片用DNA酶或RNA酶消化,然后用ISHH技術(shù)證明丟失的是DNA或RNA。如同免疫組化的吸收試驗一樣,事先與特異性的cRNA或cDNA進(jìn)行雜交。再進(jìn)行ISHH,其結(jié)果應(yīng)為陰性。④由于同義RNA探針和組織內(nèi)mRNA序列順序是相同的,應(yīng)用其進(jìn)行ISHH,結(jié)果應(yīng)為陰性。檢測系統(tǒng)的對照如乳膠或酶顯色系統(tǒng)也應(yīng)在無標(biāo)記探針的情況下進(jìn)行。
ISHH的最大優(yōu)點是它的高度特異性,它可測定組織、培養(yǎng)的單個細(xì)胞或細(xì)胞提取物中的核苷酸含量。應(yīng)用高敏感度的放射性標(biāo)記cRNA探針在理想的ISHH的實驗條件下檢測mR-NA,其敏感度可達(dá)到20個mRNA拷貝/每個細(xì)胞。由于雙鏈DNA的穩(wěn)定性,在用ISHH定位DNA時很少發(fā)生丟失,降解。在靶核苷酸序列比較伸展的情況如染色體鋪片,長于2kb的探針可以應(yīng)用。因此,其敏感性高到能夠出在染色體鋪片上,有時甚至在組織切片上的單個基因拷貝。正因為如此,對ISHH結(jié)果的解釋應(yīng)持慎重態(tài)度,特別是前人未報告過的新發(fā)現(xiàn)。因為如前所述,影響ISHH實驗結(jié)果的因素太多,比如在外科或?qū)嶒炄〔暮笪醇皶r的固定或冷凍可由于組織中mRNA的降解而導(dǎo)致假陰性結(jié)果。另外,在各種類型核酸探針進(jìn)入細(xì)胞、組織和各種器官的能力,又叫可接近性(acessiblity)各異。這些諸多因素都將影響ISHH的實驗結(jié)果。