[Key words] Polysialic acid neural cell adhesion molecule; DNA methylation; Epigenetics; Synaptic plasticity
多聚唾液酸(PSA)是線形同聚物構(gòu)成的多糖,其作用是通過神經(jīng)細(xì)胞黏附分子(NCAM)介導(dǎo)。因此,描述PSA時(shí),通常以PSA-NCAM的形式。PSA-NCAM在整個(gè)神經(jīng)系統(tǒng)的發(fā)育過程中都有重要作用,如神經(jīng)前體細(xì)胞的遷移[1],神經(jīng)細(xì)胞的分化,突觸的可塑性和空間記憶的形成[2],軸突旁路的形成[3]。本研究通過在基因水平和蛋白水平對能催化PSA合成的兩種多聚唾液酸轉(zhuǎn)移酶- ST8SiaII(STX)和 ST8SiaIV(PST)研究發(fā)現(xiàn),調(diào)控這兩種酶表達(dá)的基因轉(zhuǎn)錄起始區(qū)富含GC,而且還包含SP-1蛋白識別序列,同時(shí)這個(gè)識別序列也包含了CpG 序列[4],甲基化能夠用來作為多聚唾液酸表達(dá)的基因外調(diào)控。
1 材料與方法
1.1 材料:組織基因組DNA提取試劑:QIAGEN公司(JP);細(xì)胞基因組DNA提取試劑:GENTRA 公司(USA);鼠抗 PSA-NCAM單克隆抗體:CHEMICON INTERNATIONAL,Inc(USA)。免疫純化的生物素連接的山羊抗鼠 IgG+IgM抗體:Pierce Biotechnology,Inc(USA)。18d的胚胎鼠(E18)和成年小鼠C57BL/6J(山犁大學(xué)醫(yī)學(xué)部動(dòng)物研究中心)各50只,體重分別為100-250g。小鼠Neuron2A細(xì)胞株:山犁大學(xué)醫(yī)學(xué)部環(huán)境遺傳醫(yī)學(xué)教室。胎牛血清和dulbeccos modified eagles medium(DMEM)來自SIGMA公司。蛋白定量試劑盒:Dojindo Molecular Technologies,Inc(JP);WizardTM DNA clean-up System:promega 公司。其他試劑購自SIGMA公司。
1.2 方法
1.2.1 小鼠神經(jīng)纖維母細(xì)胞瘤的細(xì)胞株-Neuro2A,細(xì)胞培養(yǎng)及神經(jīng)細(xì)胞和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞的原代培養(yǎng):小鼠成纖維母細(xì)胞瘤的細(xì)胞株-Neuro2A,細(xì)胞常規(guī)復(fù)蘇后,以104/cm2的密度接種于培養(yǎng)皿,培養(yǎng)液含10%(v/v)胎牛血清和青霉素/鏈霉素(100μg/ml)的DMEM,置37℃,5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。細(xì)胞培養(yǎng)24h后,加入終濃度為1mM的視黃酸(retinoic acid),48h后觀察細(xì)胞的分化情況,細(xì)胞80%融合后傳代。再加入不同濃度的丙戊酸和甲硫氨酸,48h后收集細(xì)胞,提取蛋白。
1.2.2 神經(jīng)細(xì)胞和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞的原代培養(yǎng):取18d的胚胎鼠(C57BL/6J)大腦皮層細(xì)胞分別培養(yǎng)在神經(jīng)細(xì)胞培養(yǎng)液和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞培養(yǎng)液,大約2周后,細(xì)胞呈現(xiàn)互相連接生長。分別收集神經(jīng)細(xì)胞和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞,提取蛋白。
1.2.3 蛋白提。悍謩e收集Neuro2A,神經(jīng)細(xì)胞和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞,冷PBS洗滌細(xì)胞3次,用預(yù)冷的細(xì)胞裂解液(1% Triton X-100和1%的蛋白酶抑制劑)100μl裂解細(xì)胞(5000rpm,5min),超聲波使溶液均勻透明 ,考馬斯亮藍(lán)(lowry)法測定蛋白濃度醫(yī).學(xué)全.在.線網(wǎng)站payment-defi.com。
1.2.4 DNA提。悍蛛x成年鼠和胚胎鼠的大腦、小腦、基底核、海馬,加入Proteinase K,55℃過夜消化,苯酚—氯仿抽提,酒精沉淀,干燥, TE溶解,紫外分光光度儀測量DNA濃度。
分別收集Neuro2A,神經(jīng)細(xì)胞和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞,冷PBS洗滌細(xì)胞5次,加入細(xì)胞裂解液,震蕩,再經(jīng)過RNase A處理和蛋白沉淀,異丙醇抽提,酒精沉淀,TE溶解,紫外分光光度儀測量DNA濃度。
1.2.5 PSA合成的甲基化分析—甲基化特異性的PCR (methylation-specific PCR):上述提取的DNA,經(jīng)過亞硫酸鹽處理后作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),引物的設(shè)計(jì)圍繞SP-1蛋白結(jié)合位點(diǎn)(引物序列見表1)。采用甲基化特異性的PCR 檢測了STX和PST基因轉(zhuǎn)錄其始區(qū)是否發(fā)生甲基化[5]。